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基于手機(jī)的顯微鏡可進(jìn)行突變分析和靶向測序

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關(guān)鍵詞: 顯微鏡,靶向測序

    發(fā)表在《Nature Communications》上的一項研究中,美國和瑞典的研究人員基于手機(jī)相機(jī)建造了一個顯微鏡,來檢測細(xì)胞和組織中DNA測序反應(yīng)的熒光產(chǎn)物。該移動顯微鏡可以檢測超過30%的結(jié)腸癌中KRAS基因的點突變。

    瑞典斯德哥爾摩大學(xué)的合作者M(jìn)ats Nilsson表示,這項研究表明人們可以使用像手機(jī)一樣簡單的成像設(shè)備記錄DNA測序反應(yīng)。

    基于手機(jī)的顯微鏡可進(jìn)行突變分析和靶向測序

    該顯微鏡包含兩個用于檢測不同熒光團(tuán)的激光器(以電池供電),和一個用于明場成像的白光LED。手機(jī)的相機(jī)鏡頭和外部鏡頭提供約2.6倍的放大倍率。3D打印的顯微鏡平臺可以在所有三個方向操縱樣品載玻片。

    研究人員使用測序技術(shù),擴(kuò)增并熒光標(biāo)記靶DNA序列或轉(zhuǎn)錄本的拷貝。然后他們使用基于手機(jī)的顯微鏡對所得測序產(chǎn)物進(jìn)行成像。

    基于手機(jī)的顯微鏡可進(jìn)行突變分析和靶向測序

    研究意義

    加利福尼亞大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)的合作者Aydogan Ozcan表示:“突變分析和DNA測序給臨床科學(xué)帶來了夢幻般的進(jìn)步。但是它們被局限于實驗室內(nèi),不能延伸到資源相對匱乏的其他環(huán)境中。”

    Ozcan表示,使用移動顯微鏡來分析特定靶序列,可以為除大型醫(yī)院或?qū)嶒炇彝獾母嗟胤教峁┦褂酶呒壴\斷工具的機(jī)會。雖然芝加哥大學(xué)的Savas Tay沒有參與這項研究,但他表示,“這項技術(shù)的發(fā)展是對這些高端分子病理學(xué)檢測方法的民主化嘗試?!?/p>

    Tay補充說,測序診斷是如今檢測癌癥類型的黃金標(biāo)準(zhǔn),但由于資源和成本的問題,它們很難在日常生活中進(jìn)行,而這個移動顯微鏡可以通過降低成本來改變這一狀況。作者們創(chuàng)建的這一技術(shù)平臺,可以在即時檢測(point of care)站點進(jìn)行腫瘤樣品的靶向測序。

    芬蘭分子醫(yī)學(xué)研究所的Johan Lundin表示,這種顯微鏡和測序策略的組合,相對于其他突變分析技術(shù)的另一個優(yōu)點是,細(xì)胞和組織是完整的。你可以創(chuàng)建一張地圖,顯示突變發(fā)生在哪個特定的細(xì)胞中。

    要改進(jìn)的地方

    該平臺同樣具有一些限制。Lundin表示,一個開放性的問題是,這些特定技術(shù)的可行性到底如何尚不清楚,尤其是在資源匱乏的環(huán)境中。雖然醫(yī)療提供者可能在許多不同的環(huán)境中使用移動顯微鏡,但其他實驗室設(shè)備的可用性可能限制了靶向突變分析技術(shù)的可行性。

    Tay表示,顯然在樣品制備方面還有許多可改進(jìn)之處,因為它仍然需要訓(xùn)練有素的實驗室技術(shù)人員來準(zhǔn)備所有的樣品。作者曾提出微流體可以簡化樣品制備。Nilsson表示該團(tuán)隊已經(jīng)在著手開發(fā)這樣的解決方案。

    未來發(fā)展

    Ozcan說,該團(tuán)隊當(dāng)前工作目標(biāo)是使這項技術(shù)更具成本效益,更容易使用且不需太多的培訓(xùn)。

    該技術(shù)的一種可能擴(kuò)展方向是開發(fā)除KRAS突變之外的序列分析。Ozcan說,這是一個可以擴(kuò)展到各種不同癌癥并進(jìn)行不同類型突變分析的平臺。

    Nilsson說,雖然癌癥診斷很有意義,但是這樣一個非常簡單的設(shè)備非常適合用于資源匱乏環(huán)境中感染性疾病的診斷,例如結(jié)核病菌。我們可以檢測抗生素抗性基因的突變,然后進(jìn)行簡單的測試,以預(yù)測哪種抗生素治療在結(jié)核病患者中是有效的。

    他補充說,該平臺還可用于在病毒爆發(fā)期間的快速診斷。不管即時診斷的站點在哪里,你都可以向?qū)<疫h(yuǎn)程呈現(xiàn)所分析的數(shù)據(jù),然后立即反饋給用戶。

    (審核編輯: 林靜)

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